大腸桿菌雜交及基因定位
一、原理
大腸桿菌染色體呈環(huán)狀。高頻重組菌株(Hfr)的染色體上整合有F因子,當Hfr細菌與F-細菌細胞發(fā)生接合(即雜交)時Hfr細胞(供體菌)的染色體從Hfr細胞向F-細胞內(nèi)轉(zhuǎn)移。由于染色體的轉(zhuǎn)移具有一定的方向性,并且可以隨時中斷,因此根據(jù)結(jié)合后F-細菌(以重組子形式選出)中Hfr細菌染色體基因出現(xiàn)次數(shù)的多少,即可得知基因轉(zhuǎn)移的先后順序,也就是說基因在染色體上排列的順序。轉(zhuǎn)移時,靠近轉(zhuǎn)移起始點的染色體基因進入F-細胞的機率大,重組頻率高,遠離轉(zhuǎn)移起始點的基因進入F-細胞的機會少,重組率低,F(xiàn)因子大部分位于轉(zhuǎn)移起始點相對的一端(末端)。因此轉(zhuǎn)移的頻率很低。只有當接合時間很長,足以使整個染色體轉(zhuǎn)入F-細胞(受體)時,才會使F-細胞轉(zhuǎn)變?yōu)镠fr或F+狀態(tài)。
基因定位時首先要從Hfr與F-細菌的混合培養(yǎng)物中篩選出某一Hfr與F-細菌基因(選擇性標記基因)已經(jīng)發(fā)生了重組的細菌(重組子),然后在這些重組子中逐個測定其它的Hfr基因(非選擇標記)出現(xiàn)的次數(shù)。Hfr菌株染色體上的選擇性標記應(yīng)位于染色體前端,這樣才能保證以100%的頻率出現(xiàn)在重組子中。選擇性標記之后的基因,則以低于100%的頻率出現(xiàn)在重組子中。F-細胞的選擇性標記應(yīng)起到排除Hfr菌生長的作用(即反選擇)。本實驗使用的F-菌株為Strr,
Hfr菌為Strs,借此可排除Hfr菌的生長。另一方面為保證Hfr基因有機會出現(xiàn)在重組子中,反選擇性標記應(yīng)位于染色體后端。為了使Hfr菌株有較高的接合頻率,F(xiàn)-細菌應(yīng)該過量以保證每一個Hfr細菌都能與F-細菌接合(10~20:1)。
二、目的
通過本實驗,了解大腸桿菌雜交及其基因在染色體上的排列方式,并掌握大腸桿菌接合及染色體基因定位的原理與方法。
三、材料、試劑與器具
1、受體菌:FD1004 F-leu purE trp his metA ilv arg thi ara lacY xyl mtl galT strr rifr。
2、供體菌:CSH60 Hfr sup strs。
3、生理鹽水:0.85%NaCl。
4、10×A緩中液。
5、基本培養(yǎng)基。
6、LB培養(yǎng)基。
7、選擇培養(yǎng)基[B]—[G]:基本培養(yǎng)基加氨基酸(表1-2)。
8、培養(yǎng)皿、三角瓶、吸管、滅菌牙簽、搖床、酒精燈、接種環(huán)。
四、操作步驟
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1、第一天傍晚,分別接一環(huán)供體菌和受體菌于5ml LB培養(yǎng)液中,37℃振蕩培養(yǎng)10-12小時。
2、第二天清晨,各取1ml過夜培養(yǎng)物,分別加入到2個盛有5ml LB培養(yǎng)液的250ml三角瓶,37℃振蕩培養(yǎng)2-3小時。
3、吸取0.5ml供體菌和4.5ml受體菌,加入到一個無菌的250ml三角瓶中混合,置37℃搖床上培養(yǎng)100分鐘。
4、將上述接合菌液用生理鹽水稀釋100、10-1、10-2倍。
5、各吸取0.1ml稀釋液涂布在選擇培養(yǎng)基[A]平板上,每一種稀釋液涂布2個平板。同時將供體菌及受體菌分別吸取0.1ml涂布在[A]上作對照,每種各2個平板。此后均于37℃條件下培養(yǎng)48小時。
6、第四天,1)觀察和計數(shù)選擇培養(yǎng)基[A]平板上接合組和對照組的菌落生長狀況;2)在與平皿相同大小的白紙上畫100個小格,將圓片貼于選擇培養(yǎng)基[B]、[C]、[D]、[E]、[F]和[G]平板的底部,然后用滅菌牙簽從接合組選擇培養(yǎng)基[A]平板上隨機挑選100個菌落,對號點種在選擇培養(yǎng)基[B]、[C]、[D]、[E]、[F]和[G]平板的100個小格中;3)將所有平板置于37℃箱內(nèi)培養(yǎng)48小時。
7、第六天,統(tǒng)計在各種選擇平板上生長菌落的數(shù)目,記錄于表1-1中。并繪制出基因順序圖。
表1-1 各選擇培養(yǎng)基上生長的菌落數(shù)目統(tǒng)計
?
重復(fù)次數(shù) |
[B] ? arg |
[C] ? trp |
[D] ? his |
[E] ? lac |
[F] ? gal |
[G] ? rif |
1 | ||||||
2 | ||||||
3 | ||||||
4 | ||||||
5 | ||||||
6 | ||||||
總數(shù) | ||||||
平均數(shù) | ||||||
重組率* |
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?
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表1-2 選擇性培養(yǎng)基附加成份表
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培養(yǎng)基 ? 編號 |
選擇性 ? 標記 |
基本 ? 碳源 |
基本培養(yǎng)基(A)中補充物質(zhì) | ||||||||
str | rif | arg | ilv | met | leu | ade | trp | his | |||
A | Met leu str | 葡萄糖 | + | - | + | + | - | - | + | + | + |
B | (met leu str)arg | 葡萄糖 | + | - | - | + | - | - | + | + | + |
C | (met leu str)trp | 葡萄糖 | + | - | + | + | - | - | + | - | + |
D | (met leu str)his | 葡萄糖 | + | - | + | + | - | - | + | + | - |
E | (met leu str)lac | 乳糖 | + | - | + | + | - | - | + | + | + |
F | (met leu str)gal | 半乳糖 | + | - | + | + | - | - | + | + | + |
G | (met leu str)rif | 葡萄糖 | + | + | + | + | - | - | + | + | + |